La Misión de la Escuela de Ciencias Básicas se enmarca dentro de las 3 actividades fundamentales de la Universidad del Valle: “Educar en el nivel superior mediante la generación y difusión de conocimientos en los ámbitos de la ciencia a nivel de la academia de pre y postgrado, investigación y extensión; contribuyendo a la construcción y consolidación de una sociedad justa, democrática y saludable."
La Escuela de Ciencias Básicas es una unidad académica que adelanta docencia de pregrado y postgrado, investigación biomédica y extensión tanto académica como de servicios a la comunidad, aspira a consolidarse como una unidad de excelencia, pertinente, innovadora, competitiva con proyección internacional y de investigación en las ciencias biomédicas, con reconocimiento por su enfoque transdisciplinario y su responsabilidad social y ambiental.